浮游植物檢測是測量水質的指示生物，一片水域水質怎么，與浮游植物的豐厚程度和群落組成有著密不可分的關系，浮游植物的削減或過度繁衍，將預示那片水域正趨向惡化。例如湖泊（水庫）浮游植物數量的增加，特別是藍藻瘋長和成長時節的延長就是是湖泊（水庫）富營養化的一個重要標志。
       水質污染的直接結果之一，就是浮游植物品種組成的改變。在未受污染的水體中，藻類品種的組成因時節和環境要素的改變而產生改變，但是這種改變在一個特定的水體中，在一般情況是有規律的，而在被污染的水體中則是隨污染物和污染程度的不同種群組成的改變卻是無規律的。特別是那些對環境改變較敏感，喜低溫，有機質含量低，水體透明度大的金藻，在污染水體中改變明顯。
此外，浮游植物也決議了水體呈現的色彩。據藻類的生物化學分析，各大類別簡直各具特別的色素，普遍的有四大類，即葉綠素、胡蘿卜素、葉黃素和藻膽素。各門藻類因所含色素不同，藻體呈現的色彩懸殊，如綠藻門為鮮綠色，金藻門呈金黃色，藍藻門多為藍綠色等，這也是富營養化的水體呈現五光十色的原因所在。 浮游植物不僅是水域生態系統中重要的初級生產者，而且是水中溶解氧的主要供應者，它啟動了水域生態系統中的食物網，在水域生態系統的能量流動、物質循環和信息傳遞中起著至關重要的效果。
        浮游植物檢測的品種組成、群落結構和豐度改變，直接影響水體水質、系統內能量流、物質流和生物資源改變。 浮游植物素有“海洋牧草”之稱，是魚類和其他經濟動物的直接或間接的餌料，在決議水域生產性能上具有重要意義，與漁業生產有十分密切關系，世界聞名漁場都處于藻類豐厚的海域。
        而當藻類過度繁衍呈現“水華”時，水質難以長期保持，天氣改變或許導致藻類因水生生物（包括本身耗氧）、有機質很多耗氧而缺氧產生很多逝世，水質便會迅速惡化變黑，乃至發臭，影響魚類攝食，有時引起魚浮頭乃至翻塘死魚造成經濟損失。
魚池中常見的水華，按優勢種可分為14個根本類型：
1、隱藻水華2、滕口藻水華3、顫藻或席藻水華4、顫藻或席藻水華5、魚腥藻或擬魚腥藻水華6、微囊藻水華7、尖頭藻水華8、微型蘭球藻水華9、團藻目水華10、綠球藻目水華11、裸藻水華12、囊裸藻水華13、矽藻水華14、金藻水華。
池塘中以操控浮游植物檢測量來操控“水華”的呈現。可采取投喂優質飼料及其合理的投喂量、合理施肥，科學使用增氧機和及時加注新水或用投進化學物質、生物制劑等辦法，使水中的浮游植物量達到適于魚類成長的水平。